Los biopolímeros se desnaturalizan fácilmente por calentamiento, un cambio en el pH o sustancias químicas cuando están inmovilizados en un sustrato. Para prevenir la desnaturalización de los biopolímeros, desarrollamos un método para atrapar un polinucleótido en un sustrato mediante enlaces de hidrógeno utilizando partículas de sílice con superficies modificadas por cadenas aminoalquilo ([A-AM silano]/SiO). [A-AM silano]/SiO se sintetizó mediante una reacción de acoplamiento de silano de N-2-(aminoetilo)-3-aminopropiltrimetoxisilano (A-AM silano) con partículas de SiO con un diámetro de 5 m a 100 grados C durante 20 minutos. La estructura química superficial de [A-AM silano]/SiO fue caracterizada por espectroscopia infrarroja por transformada de Fourier y cálculos de orbitales moleculares. La superficie de las partículas de sílice fue modificada con A-AM silano y se formaron grupos amina primaria. [A-AM silano]/SiO fue atrapado con ácidos nucleicos de cadena sencilla [(Poly-X; X = A (adenina), G (guanina) y C (citosina)] en solución de PBS a 37 grados C durante 1 hora. Los ácidos nucleicos de cadena sencilla fueron atrapados en la superficie de [A-AM silano]/SiO mediante enlaces de hidrógeno para formar materiales conjugados. Los complejos resultantes fueron conjugados además con derivados de naranja de acridina (AO) como etiquetas fluorescentes bajo las mismas condiciones para formar complejos [AO:Poly-X:A-AM silano]/SiO. También se evaluaron los cambios en la intensidad de fluorescencia de estos complejos que se originan de las interacciones entre el ácido nucleico de cadena sencilla y compuestos aromáticos. El cambio en la intensidad mostró el orden [AO: Poly-G: A-AM silano]/SiO > [AO:Poly-A:A-AM silano]/SiO >> [AO:Poly-C:A-AM silano]/SiO. Esto sugiere que los ácidos nucleicos de cadena sencilla conjugados con cadenas aminoalquilo en las superficies de las partículas de SiO y el cambio en la intensidad de fluorescencia reflejaron la interacción molecular entre AO y la base del ácido nucleico en un polinucleótido.