La patología vegetal moderna se basa en enfoques de bioinformática para crear herramientas de diagnóstico de enfermedades de las plantas. En los últimos años, se ha generado una cantidad significativa de datos biológicos debido a los rápidos avances en técnicas de genómica y biología molecular. El progreso en la secuenciación de cultivos de importancia agrícola ha permitido desarrollar una mejor comprensión de las interacciones planta-patógeno y de la resistencia de las plantas. La disponibilidad de datos genómicos de hospedadores y patógenos ofrece asistencia efectiva en la recuperación, anotación, análisis e identificación de los aspectos funcionales para la caracterización a niveles de genes y genomas. El mapeo físico facilita la identificación y aislamiento de varios genes de resistencia (R) candidatos de diversas especies vegetales. Se han identificado y caracterizado un gran número de variaciones genéticas, como mutaciones causantes de enfermedades en el genoma, utilizando herramientas de bioinformática, y estas mutaciones deseables se han aprovechado para desarrollar resistencia a enfermedades. Además, las herramientas de edición del genoma de cultivos, a saber, el sistema CRISPR (repeticiones palindrómicas cortas interespaciadas y agrupadas)/Cas9 (asociado a CRISPR), ofrecen estrategias novedosas y eficientes para desarrollar resistencia duradera. Este artículo de revisión describe algunos aspectos relacionados con las bases de datos, herramientas y técnicas utilizadas para caracterizar genes de resistencia (R) para el manejo de enfermedades de las plantas.