La integración de la resecuenciación del genoma completo y la secuenciación del transcriptoma revela genes candidatos en el alto brillo de la cáscara de huevo
Autores: Song, Xiang; Li, Shuo; He, Shixiong; Zheng, Hongxiang; Li, Ruijie; Liu, Long; Geng, Tuoyu; Zhao, Minmeng; Gong, Daoqing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La integración de la resecuenciación del genoma completo y la secuenciación del transcriptoma revela genes candidatos en el alto brillo de la cáscara de huevo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Brillo de cáscara de huevo
Genes candidatos
Análisis de RNA-seq
Vía de señalización de calcio
Vía de interacción de ligandos neuroactivos con receptores
Resecuenciación de genoma completo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
El brillo de la cáscara de huevo es una característica importante para la manifestación de la apariencia de la cáscara. Sin embargo, ningún estudio ha identificado hasta ahora posibles genes candidatos para el brillo de la cáscara entre gallinas de alto brillo (HG) y bajo brillo (LG). El objetivo de este estudio fue realizar una investigación preliminar sobre el mecanismo de formación del brillo de la cáscara de huevo e identificar genes potenciales. Se midió el brillo de la cáscara de huevo de gallinas Rhode Island Red de 300 días desde tres aspectos. Se recolectaron tejidos uterinos de las gallinas seleccionadas HG y LG (n = 5) para RNA-seq. También se recolectaron muestras de sangre para la resecuenciación del genoma completo (WGRS). El análisis de RNA-seq mostró que se identificaron 150 genes expresados diferencialmente (DEGs) en los tejidos uterinos de las gallinas HG y LG. Estos DEGs se enriquecieron principalmente en la vía de señalización del calcio y en la vía de interacción de ligandos-receptores neuroactivos. Importante, estas dos vías también se enriquecieron significativamente en los resultados del análisis de WGRS. Un análisis conjunto adicional de los datos de WGRS y RNA-seq reveló que el receptor de 5-hidroxitriptamina 1F, la proteína de dedo de zinc 536, el modificador similar a la ubiquitina NEDD8, el factor de crecimiento nervioso y la calmodulina 1 son posibles genes candidatos para el brillo de la cáscara de huevo. En resumen, nuestra investigación proporciona una referencia para el estudio del brillo de la cáscara de huevo y sienta las bases para mejorar el brillo del huevo en la cría de ponedoras.
Descripción
El brillo de la cáscara de huevo es una característica importante para la manifestación de la apariencia de la cáscara. Sin embargo, ningún estudio ha identificado hasta ahora posibles genes candidatos para el brillo de la cáscara entre gallinas de alto brillo (HG) y bajo brillo (LG). El objetivo de este estudio fue realizar una investigación preliminar sobre el mecanismo de formación del brillo de la cáscara de huevo e identificar genes potenciales. Se midió el brillo de la cáscara de huevo de gallinas Rhode Island Red de 300 días desde tres aspectos. Se recolectaron tejidos uterinos de las gallinas seleccionadas HG y LG (n = 5) para RNA-seq. También se recolectaron muestras de sangre para la resecuenciación del genoma completo (WGRS). El análisis de RNA-seq mostró que se identificaron 150 genes expresados diferencialmente (DEGs) en los tejidos uterinos de las gallinas HG y LG. Estos DEGs se enriquecieron principalmente en la vía de señalización del calcio y en la vía de interacción de ligandos-receptores neuroactivos. Importante, estas dos vías también se enriquecieron significativamente en los resultados del análisis de WGRS. Un análisis conjunto adicional de los datos de WGRS y RNA-seq reveló que el receptor de 5-hidroxitriptamina 1F, la proteína de dedo de zinc 536, el modificador similar a la ubiquitina NEDD8, el factor de crecimiento nervioso y la calmodulina 1 son posibles genes candidatos para el brillo de la cáscara de huevo. En resumen, nuestra investigación proporciona una referencia para el estudio del brillo de la cáscara de huevo y sienta las bases para mejorar el brillo del huevo en la cría de ponedoras.