Las encuestas magnéticas se han utilizado ampliamente en investigaciones arqueológicas de campo. Sin embargo, los métodos de encuesta convencionales a menudo están restringidos por condiciones de campo complicadas y ambigüedades en la interpretación de datos. En este estudio, se diseñó un nuevo sistema de encuesta magnética para la investigación pre-arqueológica (encuesta preliminar antes de la excavación arqueológica) basado en un vehículo aéreo no tripulado (VANT) cuatrirrotor modificado y se aplicó con éxito en un área arqueológica con un relieve complejo en Huizhou, China. Los resultados muestran que la anomalía objetivo identificada por la encuesta aeromagnética del VANT corresponde bien a la ubicación de un posible sitio arqueológico. Análisis de suelo posteriores confirman aún más el valor arqueológico de los resultados aeromagnéticos del VANT y proporcionan fuertes restricciones en la interpretación de anomalías objetivo. Este estudio demuestra que el nuevo sistema aeromagnético del VANT propuesto puede adaptarse a las diversas condiciones de campo con las ventajas de flexibilidad y eficiencia, lo que tiene un gran potencial para futuras investigaciones arqueológicas.