Como enfoque principal para la propagación de nutrientes en muchas plantas leñosas, el corte de raíces es esencial para la reproducción y producción de Oliver. En este estudio, se realizaron análisis de niveles hormonales, transcriptómica y metabolómica en dos variedades con diferentes habilidades de formación de raíces adventicias (RA). El nivel más alto de JA en el día 0 y el nivel más bajo de JA en el día 18 promovieron un desarrollo superior de RA. Varios genes clave desempeñaron roles cruciales en la regulación de la interacción entre JA y otras hormonas, incluyendo la proteína F-box, la proteína similar a SAUR, la proteína LOB, el factor de transcripción AP2/ERF y la proteína CYP450. Los genes expresados diferencialmente (GEDs) y los metabolitos de la formación de RA se enriquecieron en las vías de biosíntesis de fenilpropanoides, biosíntesis de flavonoides y biosíntesis de isoflavonoides. La expresión regulada al alza de los genes en el día 18 podría contribuir a la formación de RA. Los 130 lncRNAs cis-actuantes tenían funciones regulatorias potenciales sobre los genes clave en el módulo que se correlacionó significativamente con JA y GEDs en tres vías de metabolismo. Estos revelaron moléculas clave y vías vitales que proporcionaron una visión más completa del mecanismo de formación de RA de y otras plantas.