Los trastornos neurológicos son trastornos caracterizados por la pérdida progresiva de neuronas que lleva a la discapacidad. Los neurotransmisores como la noradrenalina, la dopamina y la serotonina son parcialmente regulados por la enzima monoaminooxidasa (MAO). Los tratamientos para condiciones como el Alzheimer, el Parkinson, la ansiedad y la depresión implican el uso de IMAOs. Para apuntar a la inhibición de la enzima MAO, se preparan y evalúan varios andamios, incluidos los cumarinas modificados, los sustituyentes de ácido carboxílico de cromona, los derivados de piridazina y la indolilmetilamina. La investigación presentada aquí se centra en combinar diferentes herramientas computacionales para encontrar nuevos inhibidores de la proteína MAO-B. Descubrimos 5 posibles inhibidores químicos utilizando las técnicas computacionales mencionadas anteriormente. Encontramos cinco inhibidores moleculares con alta afinidad de unión utilizando métodos computacionales. Estas cinco moléculas mostraron una alta afinidad de unión; son -10,917, -10,154, -10,223, -10,858 y -9,629 Kcal/mol, respectivamente. Además, los inhibidores seleccionados fueron examinados más a fondo por actividad in vitro, y su afinidad de unión fue confirmada utilizando un ensayo basado en enzimas. En resumen, los estudios computacionales realizados aquí utilizando dinámica molecular y cálculos de energía libre también pueden ser utilizados para diseñar y predecir derivados altamente potentes como inhibidores de la MAO-B, y estos mejores inhibidores ayudan en el desarrollo de nuevos medicamentos para enfermedades neurológicas como el Alzheimer y el Parkinson.