La arquitectura radicular de una variedad de plantas hospedadoras se altera en respuesta a la infección. Este trabajo tuvo como objetivo identificar los genes hospedadores involucrados en el desarrollo radicular durante la infección. Se creó un mutante deficiente del regulador del sistema de secreción tipo III en GMI1000. El mutante mostró una disminución en la virulencia, pero presentó un efecto supresor similar al de GMI1000 tipo salvaje en el desarrollo radicular del tomate. Basado en un análisis transcriptómico comparativo, se encontraron 209 genes que mostraron el mismo patrón de expresión alterado en las raíces infectadas de GMI1000 y el mutante en relación con las raíces no inoculadas. Entre ellos, la quinasa receptora asociada a la pared celular fue sustancialmente regulada a la baja en las raíces infectadas de GMI1000 y el mutante. La reducción de llevó a una longitud de raíz primaria más corta y menos raíces laterales en el tomate, así como en . El es un objetivo clave suprimido por para moldear el desarrollo radicular alterado durante la infección.