El papel de los proteoglicanos en el sistema nervioso central (SNC) es un campo en rápida evolución y tiene importantes implicaciones en el ámbito de las lesiones del SNC. Los proteoglicanos de sulfato de condroitina (CSPGs) aumentan en abundancia tras el daño a la médula espinal e inhiben el crecimiento de neuritas. Los avances significativos en la comprensión de la interacción entre las neuritas en crecimiento y los CSPGs han creado la necesidad de análisis más robustos y cuantitativos para profundizar en nuestra comprensión de esta interacción. Informamos sobre el uso de un ensayo de alto rendimiento para determinar el efecto de varias modificaciones post-traduccionales del aggrecano sobre el crecimiento de neuritas a partir de células NS-1 (una derivada de la línea celular PC12). El aggrecano contiene sulfato de condroitina, sulfato de queratano y oligosacáridos N-enlazados (N-glicanos), cada uno susceptible de ser eliminado a través de diferentes digestiones enzimáticas. Utilizando un enfoque de digestión secuencial, encontramos que el sulfato de condroitina y los N-glicanos, pero no el sulfato de queratano, contribuyen a la inhibición del crecimiento de neuritas por el aggrecano unido al sustrato. Por primera vez, hemos demostrado que los oligosacáridos N-enlazados en el aggrecano contribuyen a su inhibición de la neuritogénesis.