Las epidemias de enfermedades infecciosas amenazan la salud humana y la estabilidad de la sociedad. Las plantas farmacófagas son ricas en compuestos bioactivos que constituyen una biblioteca de medicamentos segura para agentes antimicrobianos. En este estudio, hemos descifrado por primera vez los ingredientes antibacterianos y los modos del extracto de fase metanol (EPM) de la fruta de Lour. Los resultados han revelado que la tasa antibacteriana del EPM fue del 63.64%, dirigido a 22 especies de bacterias patógenas comunes. El EPM fue purificado adicionalmente mediante cromatografía líquida de alta resolución (Prep-HPLC), y se obtuvieron tres constituyentes diferentes (Fracciones 1-3). De estos, el tratamiento de la Fracción 2 aumentó significativamente la fluidez y permeabilidad de la membrana celular, redujo la hidrofobicidad de la superficie celular y dañó la integridad de la estructura celular, lo que llevó a la fuga de macromoléculas celulares de patógenos Gram-positivos y Gram-negativos (< 0.05). Noventa y nueve compuestos en la Fracción 2 fueron identificados mediante análisis de UHPLC-MS, entre los cuales el ácido 4-hidroxifenilacetilglutámico representó el 30.89%, seguido de lubiprostone (11.86%), miltirona (10.68%) y ácido oleico (10.58%). El análisis transcriptómico comparativo reveló vías metabólicas significativamente alteradas en los patógenos representativos tratados con la Fracción 2 (< 0.05), indicando múltiples modos antibacterianos. En general, este estudio demuestra por primera vez la actividad antibacteriana del EPM de la fruta de Lour., y debería ser útil para su aplicación en las industrias medicinal y de conservantes alimentarios contra patógenos comunes.