Las enfermedades virales afectan el rendimiento y la calidad de la fruta y acortan la vida productiva de los frutos de hueso ( spp. de la familia ). De más de cincuenta virus conocidos que infectan estos cultivos, el virus de la cereza A (CVA) se encuentra entre los más comunes, y el virus de la cereza pequeña 1 (LChV1) es uno de los más importantes desde el punto de vista económico. Utilizando secuenciación de alto rendimiento, se secuenciaron, ensamblaron y caracterizaron genomas completos de aislamientos de CVA y LChV1, encontrados en híbridos inter-especies en la colección de los Jardines Botánicos Nikita, Rusia. Se encontró CVA en el híbrido x y en el análisis filogenético se agrupó con aislamientos de virus no cereza. El aislamiento LChV1 Stepnoe fue detectado en (( Ehrh. x L.) x Vill.) trihíbrido, sugiriendo que tanto y potencialmente pueden ser los hospedadores de LChV1. El aislamiento Stepnoe estaba más estrechamente relacionado con el aislamiento de Grecia G15_3 de cereza dulce, compartiendo un 77.3% de identidad a nivel de nucleótidos. Posiblemente, el aislamiento ruso altamente divergente representa un grupo filogenético más de este virus. Este es el primer informe de CVA y LChV1 de Rusia, ampliando la información sobre su distribución geográfica y diversidad genética.