Primer informe y caracterización molecular del virus similar a Umbra en árboles de higuera caprino en Crimea
Autores: Motsar, Elena; Sheveleva, Anna; Sharko, Fedor; Mitrofanova, Irina; Chirkov, Sergei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Primer informe y caracterización molecular del virus similar a Umbra en árboles de higuera caprino en Crimea
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Mosaico de higo
Enfermedad viral
Colección de germoplasma de higo
Península de Crimea
Virus similar al umbra de higo
FULV
Secuenciación de alto rendimiento
RT-PCR
Genomas
Virus similar al umbra de higo de Crimea
FULV-CR
Análisis filogenético
Diversidad genética
Co-infección.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El mosaico de higo es la enfermedad viral más grave que afecta a los higos. Se realizó un muestreo de una colección de germoplasma de higo del Jardín Botánico Nikita en la Península de Crimea para detectar virus utilizando secuenciación de alto rendimiento y RT-PCR con cebadores específicos para virus de higo conocidos. Se generaron lecturas relacionadas con el virus umbra-like de higo (FULV) en muestras de árboles de caprifigo (polinizador) de la variedad Belle dure. Los árboles de otras variedades, así como los árboles , , y , dieron negativo para FULV. Genomas casi completos de cinco aislados del virus umbra-like de higo de Crimea (FULV-CR) compartieron una identidad del 99.4% al 99.9% y estaban más estrechamente relacionados (85.2% de identidad) con el aislado de FULV de Hawái Oahu1 (MW480892). Basado en su estructura genómica y un análisis filogenético, se determinó que los aislados de FULV-CR son virus umbra-like de Clase 2 que infectan dicotiledóneas y parecen ser formas altamente divergentes del mismo virus encontrado recientemente en Hawái, EE. UU. Este es el primer informe de un virus umbra-like encontrado en higos en Crimea y fuera de Hawái, ampliando la información sobre la distribución geográfica y la diversidad genética de FULV. Todas las plantas positivas para FULV en Crimea también estaban coinfectadas con el virus del mosaico de higo, el badnavirus 1 de higo y el virus badna FI de la vid.
Descripción
El mosaico de higo es la enfermedad viral más grave que afecta a los higos. Se realizó un muestreo de una colección de germoplasma de higo del Jardín Botánico Nikita en la Península de Crimea para detectar virus utilizando secuenciación de alto rendimiento y RT-PCR con cebadores específicos para virus de higo conocidos. Se generaron lecturas relacionadas con el virus umbra-like de higo (FULV) en muestras de árboles de caprifigo (polinizador) de la variedad Belle dure. Los árboles de otras variedades, así como los árboles , , y , dieron negativo para FULV. Genomas casi completos de cinco aislados del virus umbra-like de higo de Crimea (FULV-CR) compartieron una identidad del 99.4% al 99.9% y estaban más estrechamente relacionados (85.2% de identidad) con el aislado de FULV de Hawái Oahu1 (MW480892). Basado en su estructura genómica y un análisis filogenético, se determinó que los aislados de FULV-CR son virus umbra-like de Clase 2 que infectan dicotiledóneas y parecen ser formas altamente divergentes del mismo virus encontrado recientemente en Hawái, EE. UU. Este es el primer informe de un virus umbra-like encontrado en higos en Crimea y fuera de Hawái, ampliando la información sobre la distribución geográfica y la diversidad genética de FULV. Todas las plantas positivas para FULV en Crimea también estaban coinfectadas con el virus del mosaico de higo, el badnavirus 1 de higo y el virus badna FI de la vid.