Los efectos adversos del transporte surgen de la acumulación de diversos estresores, que en conjunto comprometen el bienestar animal. Este estudio tuvo como objetivo evaluar las respuestas conductuales a corto plazo, el estrés fisiológico y la calidad de la carne como indicadores de bienestar en el ganado japonés negro a su llegada a la instalación de sacrificio. Se observaron un total de 154 animales de diferentes granjas de producción. Se utilizaron modelos lineales mixtos generalizados, con efectos fijos que incluían tipo de animal, peso, temporada, origen, tamaño de carga, distancia, experiencia de transporte y su interacción con los períodos de tiempo. Se observaron comportamientos significativos post-transporte y una concentración elevada de cortisol, particularmente en novillas, animales más ligeros, aquellos transportados en verano, de múltiples granjas, con tamaños de carga altos o sin experiencia previa de transporte. Los novillos, animales más pesados y los grupos de la misma granja produjeron pesos de canal más altos, mientras que el ganado transportado con un tamaño de carga bajo tuvo mejores puntuaciones de marmoleo y una mayor probabilidad de alcanzar canales de grado A5. Estos hallazgos sugieren que las prácticas de manejo deben centrarse en los animales más susceptibles al estrés por transporte y que se deben implementar estrategias como mitigar el estrés por calor, transportar animales de la misma granja de producción y reducir los tamaños de carga para mejorar el bienestar y la calidad de la carne a su llegada.