Una estrategia presentada como alternativa para evitar el uso de sustancias químicas en la desinfección del suelo consiste en la técnica de biosolarización. El objetivo del presente estudio fue analizar el efecto de la estacionalidad en la efectividad de la biosolarización con diferentes enmiendas orgánicas para el control de f. sp. (FOLAC) en plantas de lechuga, y comparar los resultados obtenidos utilizando un bioensayo clásico de infectividad del suelo y una técnica molecular basada en qPCR. Ninguna de las plantas sometidas a biosolarización en la temporada de verano (469-700 y 0-463 h con temperatura > 42 gradosC a 15 y 30 cm de profundidad del suelo, respectivamente) mostró daño por el patógeno excepto el control no tratado. Por el contrario, en otoño (3-5 y 0-0 h a temperatura = 38-40 gradosC a 15 y 30 cm de profundidad del suelo, respectivamente), solo dos tratamientos de biosolarización (trigo + estiércol semi compostado, pellets de girasol) que redujeron el inóculo de FOLAC en el suelo y las plantas no mostraron ninguna enfermedad en la profundidad más baja (15 cm) en el bioensayo de infectividad del suelo. Este mismo resultado solo se obtuvo a 30 cm de profundidad del suelo en el tratamiento de biosolarización con pellets de girasol. El número de secuencias de FOLAC por gramo de suelo determinado con qPCR fue nulo en los tratamientos de biosolarización en verano en ambas profundidades del suelo y correspondió a la ausencia de enfermedad en el bioensayo de infectividad del suelo. Un umbral de 145 secuencias por gramo de suelo determinado por la técnica molecular basada en qPCR correspondió a la presencia del 10% de plantas de lechuga enfermas infectadas por FOLAC. Por lo tanto, esta técnica molecular se ha mostrado útil para establecer los umbrales de inóculo del suelo necesarios para la infección de cultivos por patógenos, al tiempo que se reducen el tiempo y las tareas de ejecución necesarias para realizar bioensayos de infectividad del suelo.