Objetivo: Nuestro estudio tuvo como objetivo analizar la estructura de la comunidad de diatomeas del plancton, perifiton y sedimentos superficiales, así como su relación con las variables ambientales de dos embalses, Tanque Grande y Cabuçu, ubicados en el municipio de Guarulhos, Región Metropolitana de São Paulo.

Métodos: Se establecieron tres estaciones de muestreo en cada embalse. Se recolectaron muestras de agua y perifiton durante el período seco (agosto de 2013) y el período lluvioso (enero de 2014), mientras que los sedimentos se muestrearon únicamente durante el período seco. Se determinaron variables limnológicas abióticas del agua y se realizaron análisis cuantitativos y cualitativos tras la oxidación de las muestras de diatomeas.

Resultados: Ambos embalses presentaron bajos valores de conductividad eléctrica, pH y nutrientes. La comunidad de diatomeas estuvo representada por 30 taxones distribuidos en 20 géneros. La diversidad de diatomeas fue mayor en el plancton, con tres especies exclusivas. Todos los taxones recolectados en los sedimentos superficiales también se encontraron en el plancton. El perifiton estuvo representado por seis taxones exclusivos de este hábitat.

Conclusión: Nuestros resultados indicaron que las variables ambientales fueron responsables de los cambios limnológicos en los dos embalses. En los embalses estudiados, la composición de especies de diatomeas difirió ligeramente entre el plancton y los sedimentos superficiales, mientras que en el perifiton se observó una comunidad distinta, con presencia de especies exclusivas. Los dos períodos climáticos mostraron diferencias en la abundancia de especies, pero no se observaron diferencias considerables en la composición de especies entre los dos embalses.