Realizamos un estudio sobre invertebrados en sustratos artificiales con diferentes pinturas antiincrustantes para responder a las siguientes preguntas: 1) ¿Existe una menor acumulación de materia orgánica en sustratos con pinturas antiincrustantes?, 2) ¿La colonización de invertebrados se ve influenciada por la liberación de biocidas de las pinturas antiincrustantes?, 3) ¿La colonización de invertebrados acuáticos se ve influenciada positivamente por el material acumulado sobre la superficie del sustrato?, y 4) ¿Es similar la composición del conjunto de invertebrados entre las diferentes pinturas antiincrustantes? Para responder a estas preguntas, se instalaron cuatro estructuras en el río Baía el 1 de febrero de 2007. Cada estructura estaba compuesta por 7 tableros de madera: 5 tableros pintados con cada tipo de pintura antiincrustante (T1, T2, T3, T4 y T5), uno pintado solo con imprimación (Pr) y el otro sin pintura (Cn). Después de 365 días, observamos una mayor acumulación de materia orgánica en los sustratos con recubrimientos de pintura T2 y T3. Se registró Limnoperna fortunei en todas las pinturas analizadas, con mayores densidades en el control, la imprimación, T2 y T3. La colonización de quironómidos y náidos en el sustrato se vio influenciada positivamente por la densidad de L. fortunei. El escalamiento multidimensional no métrico (NMDS) de la comunidad de invertebrados evidenció la clara distinción de los ensambles de invertebrados entre las pinturas. Las pinturas T2 y T3 fueron las más similares al control y a la imprimación. Nuestros resultados sugieren que las pinturas antiincrustantes aplicadas sobre sustratos dificultan la colonización de invertebrados al disminuir la densidad y la riqueza de estos.