El uso indiscriminado de antihelmínticos para controlar nematodos parásitos en caballos ha llevado a la aparición de resistencia a los antihelmínticos en todo el mundo. Sin embargo, no hay datos disponibles sobre el uso de ivermectina para tratar infecciones por estróngilos en caballos domesticados en Tailandia. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo utilizar la prueba de reducción del conteo de huevos fecales (FECR) para determinar el período de reaparición de huevos de estróngilos (ERP). Además, se incorpora el enfoque de metabarcoding del nemabioma para estudiar los patrones de infección por especies de estróngilos tras el tratamiento con ivermectina. Los resultados del estudio indican que, aunque la ivermectina eliminó eficazmente los parásitos adultos de estróngilos en dos semanas después del tratamiento, el ERP se acortó a 6 semanas después del tratamiento con un FECR medio del 70.4% (IC 95% 46.1-84.0). Esto indica potencialmente un cambio reciente en el rendimiento del fármaco. Además, el metabarcoding del nemabioma reveló que las especies de estróngilos tienen diferentes niveles de susceptibilidad en respuesta a los fármacos antihelmínticos. La reducción en el ERP se asoció con la reaparición temprana de especies específicas, dominadas por y , lo que indica la menor susceptibilidad de estas especies. En contraste, , , y no se encontraron después del tratamiento, lo que indica el alto nivel de susceptibilidad de estas especies. Esta información es vital para comprender los factores que contribuyen a la aparición de resistencia y para diseñar estrategias para gestionar y controlar las infecciones por estróngilos en caballos.