Las subunidades de la cadena respiratoria mitocondrial están codificadas tanto por los genomas mitocondriales como por los nucleares, imponiendo restricciones evolutivas debido a las posibles incompatibilidades entre las mutaciones en estos genomas. Nuestro estudio demuestra que el intercambio de ADN mitocondrial (ADNmt) entre dos cepas de levadura de laboratorio aumenta la frecuencia de pérdida de ADNmt y reduce su capacidad respiratoria, lo que sugiere una coadaptación de los genomas mitocondriales y nucleares a nivel intraespecífico. También mostramos que la capacidad del ADNmt egoísta para desplazar otras variantes en células de levadura heteroplasmáticas depende principalmente de sus secuencias de ADNmt en lugar del fondo del genoma nuclear. Estos hallazgos subrayan las complejas interacciones entre los genomas mitocondriales y nucleares.