Este estudio tuvo como objetivo analizar diversas alteraciones en la morfología de la cabeza del esperma y su asociación con la inestabilidad del núcleo y la insuficiencia de protamina en el esperma. Se utilizó semen congelado-descongelado de veinte toros locales indonesios para todas las etapas de este estudio. Los resultados de las evaluaciones de defectos en la cabeza del esperma se utilizaron para agrupar a los toros, en alto (HD) y bajo (LD). El daño en el ADN del esperma se evaluó utilizando Naranja Acridina y Halomax. La abundancia de la proteína PRM1 se llevó a cabo utilizando un ensayo inmunoenzimático, mientras que la expresión del gen PRM1 se realizó utilizando RT-qPCR. La deficiencia de PRM se llevó a cabo utilizando CMA. Varios tipos de defectos en la cabeza del esperma en los HD fueron significativamente más altos (< 0.05) que en los toros LD. El daño en el ADN del esperma mostró una diferencia significativa (< 0.05) entre los toros HD y LD. La abundancia de PRM1 se redujo significativamente (< 0.05) en los toros HD. La deficiencia de PRM fue significativamente (< 0.05) mayor en los toros HD que en los toros LD. La deficiencia de PRM en los toros se correlacionó significativamente (< 0.01) con los defectos en la cabeza del esperma, el daño en el ADN y la abundancia de PRM1. La falta de protamina en el esperma podría afectar la estabilidad del núcleo del esperma e inducir alteraciones morfológicas en la cabeza del esperma.