La incompletitud de los datos puede formar una barrera difícil de superar para decodificar el mecanismo de la vida
Autores: Kondratyeva, Liya; Alekseenko, Irina; Chernov, Igor; Sverdlov, Eugene
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
La incompletitud de los datos puede formar una barrera difícil de superar para decodificar el mecanismo de la vida
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Incompletud
Sistemas biológicos
Genes
Organismos
Proteínas
Interactoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
En esta breve revisión, intentamos demostrar que la incompletitud de los datos, así como la heterogeneidad intrínseca de los sistemas biológicos, pueden formar barreras muy fuertes y posiblemente insuperables para los investigadores que intentan descifrar los mecanismos de funcionamiento de los sistemas vivos. Ilustramos este desafío utilizando los dos organismos más estudiados: , con un 34.6% de genes que carecen de evidencia experimental de función, y , con proteínas identificadas para aproximadamente el 50% de sus genes. Otro ejemplo sorprendente es una entidad unicelular artificial llamada JCVI-syn3.0, con un conjunto mínimo de genes. Un total del 31.5% de los genes de JCVI-syn3.0 no pueden atribuirse a una función biológica específica. El proyecto de mapeo del interactoma humano identificó solo el 5-10% de todas las interacciones proteicas en humanos. Además, la mayoría de los datos disponibles son instantáneas estáticas, y es apenas posible generar modelos realistas de los procesos dinámicos dentro de las células. Además, los interactomas existentes reflejan la interacción de facto pero no su resultado funcional, que es una propiedad emergente impredecible. Quizás la completitud de los datos moleculares sobre cualquier organismo vivo está más allá de nuestro alcance y representa un problema insoluble en biología.
Descripción
En esta breve revisión, intentamos demostrar que la incompletitud de los datos, así como la heterogeneidad intrínseca de los sistemas biológicos, pueden formar barreras muy fuertes y posiblemente insuperables para los investigadores que intentan descifrar los mecanismos de funcionamiento de los sistemas vivos. Ilustramos este desafío utilizando los dos organismos más estudiados: , con un 34.6% de genes que carecen de evidencia experimental de función, y , con proteínas identificadas para aproximadamente el 50% de sus genes. Otro ejemplo sorprendente es una entidad unicelular artificial llamada JCVI-syn3.0, con un conjunto mínimo de genes. Un total del 31.5% de los genes de JCVI-syn3.0 no pueden atribuirse a una función biológica específica. El proyecto de mapeo del interactoma humano identificó solo el 5-10% de todas las interacciones proteicas en humanos. Además, la mayoría de los datos disponibles son instantáneas estáticas, y es apenas posible generar modelos realistas de los procesos dinámicos dentro de las células. Además, los interactomas existentes reflejan la interacción de facto pero no su resultado funcional, que es una propiedad emergente impredecible. Quizás la completitud de los datos moleculares sobre cualquier organismo vivo está más allá de nuestro alcance y representa un problema insoluble en biología.