La producción de carne de conejo enfrenta desafíos debido a la prevalencia de enfermedades gastrointestinales en conejos, exacerbadas por las restricciones en el uso de antibióticos en la producción animal europea. Los macroalgas marinas, ricas en compuestos bioactivos como los polisacáridos solubles, representan soluciones prometedoras a este problema. Sin embargo, la investigación sobre los efectos de las macroalgas y los mecanismos subyacentes en conejos es limitada, especialmente en entornos comerciales. Este estudio tuvo como objetivo evaluar el impacto de (desecadas) y (extracto desecado y hidrolizado) en conejos en el rendimiento de crecimiento y la salud intestinal en un contexto de granja comercial. Un total de 96 camadas (8 conejos/camada) de conejos cruzados destetados a los 33 días de edad fueron asignados al azar a 4 grupos experimentales (control, desecadas, desecadas y extracto hidrolizado; 24 réplicas/tratamiento) y monitoreados desde el destete hasta el sacrificio a los 61 días de edad. Los indicadores clave de salud intestinal fueron evaluados 14 días después del destete mediante el recuento de coccidias, el aislamiento de microflora específica y el examen de muestras histológicas. Además, se determinaron los marcadores intestinales relevantes (composición del microbioma, contenido de mucina y expresión génica relacionada con la respuesta inmune y proteínas de unión estrecha) para dilucidar los posibles mecanismos involucrados. La inclusión de macroalgas en la dieta no influyó en el rendimiento de crecimiento de los animales. tuvo un efecto positivo en la reducción de los recuentos de coccidias ( = 0.10) y en la mejora de la morfología mucosa ( < 0.001), lo cual posiblemente se pueda atribuir a la modulación de la microbiota y la mejora de la funcionalidad mucosa. tuvo un efecto favorable en las proteínas de unión estrecha del intestino ( < 0.001), mejorando la función de barrera intestinal. Estos hallazgos sugieren el potencial de las macroalgas para modificar el microbioma intestinal al reducir la presencia de bacterias inflamatorias. Se necesita más investigación para dilucidar los mecanismos involucrados y optimizar la suplementación de macroalgas en la nutrición de conejos para una mejor salud intestinal.