Desde Darwin, muchos investigadores en evolución y comportamiento han considerado el papel de los rasgos fenotípicos que favorecen la domesticación de animales no humanos. Entre los rasgos propuestos se encuentran la estructura social de una especie, el nivel de interacciones agonísticas intra- e inter-específicas, los comportamientos sociosexuales, las estrategias parentales, la reacción a los humanos, la preferencia de hábitat, los hábitos dietéticos, las trayectorias de desarrollo y la utilidad para los humanos. Sin embargo, existe poca o ninguna evidencia filogenética comparativa sobre la importancia de estos atributos para la domesticación de animales. Además, en lugar de considerar la domesticación como un evento dicotómico (no domesticado vs. domesticado), los humanos y sus posibles domesticados enfrentaron numerosos desafíos/obstáculos socioecológicos durante el proceso de domesticación antes de alcanzar la etapa de plena domesticación. El presente estudio exploró la influencia de la masa corporal adulta, la gregariosidad, el ancho dietético y la reacción a los humanos en el proceso de domesticación de los ungulados. El modelo comparativo filogenético reveló que la miopatía por captura (CM), como un indicador de la reacción a los humanos, influyó negativamente y de manera significativa en el proceso de domesticación. El presente artículo también exploró la evolución de la CM en especies equinas en respuesta a la presencia de grandes depredadores carnívoros durante el Pleistoceno. Las ecologías que preservaron la mayoría de los grandes depredadores carnívoros de las especies equinas también presentaron más taxones equinos con CM (por ejemplo, cebras), que por lo tanto eran menos adecuados para la domesticación.