El cambio climático está alterando los patrones de precipitación en las zonas áridas de Asia Central, desestabilizando los ecosistemas desérticos. Los hongos micorrízicos arbusculares (AM), microorganismos del suelo clave que forman simbiosis con la mayoría de las plantas, mantienen críticamente la estabilidad del ecosistema, sin embargo, sus mecanismos para regular especies de plantas individuales y sostener la estabilidad de la comunidad siguen siendo poco claros. Realizamos un experimento in situ de 5 años en el desierto de Gurbantunggut, probando cómo los hongos AM influyen en la estabilidad de la comunidad de plantas del desierto bajo una mayor precipitación. Utilizando un diseño de bloques aleatorizados con tres tratamientos: control (CK), aumento de precipitación (W) y precipitación con el fungicida Benomyl (BW), monitoreamos la dinámica de la comunidad de plantas. Descubrimos que tanto el aumento de la precipitación como los hongos AM alteraron la estructura de la comunidad de plantas sin afectar la diversidad. La precipitación aumentó la productividad primaria neta en la parte aérea (ANPP) y la densidad, mejorando la estabilidad de la comunidad a través de especies dominantes, apoyando la hipótesis de la relación de masa. Los hongos AM estabilizaron aún más la comunidad al aumentar el ANPP y mejorar la estabilidad de las especies comunes bajo una mayor precipitación, mientras que la contribución de las especies raras también fue no despreciable, alineándose con la hipótesis de seguro subordinado. En general, nuestro estudio aclara cómo el aumento de la precipitación y los hongos AM regulan la estabilidad de la comunidad de plantas a nivel de especie. Específicamente, supera las brechas clave al revelar el papel fundamental de los hongos AM en la estabilización de comunidades a través del sostenimiento de la estabilidad de las especies comunes.