Deaza-epothilone C, que incorpora un grupo tiofenilo en lugar del heterociclo de tiazol en la cadena lateral natural de epothilona, ha sido preparado por semisíntesis a partir de epothilona A, con el fin de evaluar la contribución del nitrógeno de tiazol a la unión a microtúbulos. La síntesis se basó en la esterificación de un fragmento de ácido carboxílico derivado de epothilona A conocido y un bloque de construcción de alcohol completamente sintético que incorpora el segmento de cadena lateral modificado y el posterior cierre de anillo mediante metátasis de olefinas. Este último procedió con selectividad desfavorable y en bajo rendimiento. Se revelaron diferencias distintas en el comportamiento químico entre los intermediarios avanzados derivados de tiophene y lo que se ha informado para los congéneres basados en tiazol correspondientes. En comparación con la epothilona C natural, la energía libre de unión de deaza-epothilona C a microtúbulos se redujo en aproximadamente 1 kcal/mol o menos, lo que indica un papel distinto pero no decisivo del nitrógeno de tiazol en la interacción de las epothilonas con el sistema tubulina/microtúbulo. A diferencia de la epothilona C natural, deaza-epothilona C carecía de actividad antiproliferativa in vitro hasta una concentración de 10 M, presumiblemente debido a una estabilidad insuficiente en el medio de cultivo celular.