El uso del cereal perenne pasto trigo intermedio ((Host) Barkworth & D.R. Dewey) puede tener el potencial de mantener la salud y fertilidad del suelo a través del desarrollo de un extenso sistema radicular. Sin embargo, las referencias son escasas para demostrar su influencia potencial en un contexto de una fase de crecimiento limitada de cereales perennes, integrada en la sucesión de cultivos de cereales anuales. Este estudio tiene como objetivo determinar qué tan temprano difiere un sistema radicular de un cultivo perenne del de un cultivo anual a través del desarrollo de raíces, rasgos radiculares e indicadores microbianos. Nuestros resultados indican que el pasto trigo intermedio de dos años promueve un sistema radicular más denso y profundo con proporcionalmente más biomasa y longitud de raíces más profundas en el perfil del suelo. Desde la primera temporada de crecimiento, el cereal perenne demostró una serie de rasgos radiculares típicos de una estrategia más conservadora de recursos y una mayor asignación de recursos orientada hacia el suelo. Los indicadores de biomasa fúngica del suelo se mejoraron. Los indicadores de hongos micorrícicos arbusculares (AMF) se encontraron notablemente mejorados a 1 m de profundidad durante la segunda temporada de crecimiento. Este estudio proporciona evidencia de que la agricultura basada en cereales puede beneficiarse del potencial de sistemas radiculares más profundos y longevos del pasto trigo intermedio para gestionar los suelos. El uso periódico de una fase perenne a corto plazo en la rotación de cultivos tiene el potencial de mejorar el funcionamiento del suelo a largo plazo.