El análisis de identificación, caracterización y expresión a nivel genómico de la familia de genes de la Sintasa de Pirofosfato de Geranilgeranilo (GGPPS) revela su importancia en los cloroplastos de L
Autores: Yan, Longxiang; Fang, Zhiyuan; Zhang, Na; Yang, Limei; Zhang, Yangyong; Zhuang, Mu; Lv, Honghao; Ji, Jialei; Wang, Yong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El análisis de identificación, caracterización y expresión a nivel genómico de la familia de genes de la Sintasa de Pirofosfato de Geranilgeranilo (GGPPS) revela su importancia en los cloroplastos de L
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Enzima
Biosíntesis de terpenos
Repollo
Genes
Cloroplastos
Biosíntesis de clorofila
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 46
Citaciones: Sin citaciones
GGPPS (geranilgeranil pirofosfato sintasa) es una enzima crucial en la vía de biosíntesis de terpenoides. Los terpenoides desempeñan roles esenciales en la biosíntesis de clorofila y en el desarrollo de la col (L. var. L.), un importante vegetal crucífero a nivel mundial. Sin embargo, la información disponible sobre los genes GGPPS es limitada. En este estudio, examinamos 10 genes del genoma. La predicción de localización subcelular sugiere que las proteínas BoGGPPS se expresan principalmente en los cloroplastos y plastos. Genes similares presentaron una estructura y motivo similares. El análisis de distribución, colinealidad y Ka/Ks reveló múltiples eventos de duplicación dentro de la familia génica. La col podría participar en respuestas a la luz y hormonales a través del análisis de elementos -actuantes. El análisis de estructura tridimensional demostró la abundancia de alfa-hélices y hélices aleatorias entre los miembros, lo que sugiere sus funciones importantes. Basándonos en qRT-PCR, observamos diferencias notables en los niveles de transcripción de genes entre hojas y silicuas. presentó niveles de transcripción significativamente más altos en silicuas de tipo salvaje (WT) en comparación con (), y el análisis de localización subcelular confirmó su expresión en cloroplastos, lo que implica su papel esencial en la síntesis de cloroplastos. Estos hallazgos sientan las bases para una exploración adicional y un análisis funcional en profundidad de los genes y su relación con los terpenoides en el contexto de la síntesis de clorofila en .
Descripción
GGPPS (geranilgeranil pirofosfato sintasa) es una enzima crucial en la vía de biosíntesis de terpenoides. Los terpenoides desempeñan roles esenciales en la biosíntesis de clorofila y en el desarrollo de la col (L. var. L.), un importante vegetal crucífero a nivel mundial. Sin embargo, la información disponible sobre los genes GGPPS es limitada. En este estudio, examinamos 10 genes del genoma. La predicción de localización subcelular sugiere que las proteínas BoGGPPS se expresan principalmente en los cloroplastos y plastos. Genes similares presentaron una estructura y motivo similares. El análisis de distribución, colinealidad y Ka/Ks reveló múltiples eventos de duplicación dentro de la familia génica. La col podría participar en respuestas a la luz y hormonales a través del análisis de elementos -actuantes. El análisis de estructura tridimensional demostró la abundancia de alfa-hélices y hélices aleatorias entre los miembros, lo que sugiere sus funciones importantes. Basándonos en qRT-PCR, observamos diferencias notables en los niveles de transcripción de genes entre hojas y silicuas. presentó niveles de transcripción significativamente más altos en silicuas de tipo salvaje (WT) en comparación con (), y el análisis de localización subcelular confirmó su expresión en cloroplastos, lo que implica su papel esencial en la síntesis de cloroplastos. Estos hallazgos sientan las bases para una exploración adicional y un análisis funcional en profundidad de los genes y su relación con los terpenoides en el contexto de la síntesis de clorofila en .