El monitoreo genético representa una herramienta valiosa para los gestores de recursos naturales en la gestión y conservación de poblaciones silvestres de plantas y animales. A pesar de que existe una clara necesidad de establecer programas de monitoreo genético de manera urgente, podrían surgir varias barreras dependiendo de la región, como la falta de financiamiento, las lagunas en las estrategias nacionales, la escasa colaboración internacional y los problemas transfronterizos. Esta revisión tiene como objetivo analizar las variables genéticas y no genéticas utilizadas en estudios y proyectos anteriores para revelar las premisas para llevar a cabo estudios genéticos sobre múltiples especies utilizando el conocimiento existente. Sin embargo, encontramos que el marcador de sexo, el número de muestras por individuo por año y la tasa de muestras no invasivas estaban correlacionados entre sí, así como el número de tipos de muestras utilizadas y el tiempo de monitoreo. Mostramos que los países en desarrollo enfrentan desafíos debido al costo de los estudios genéticos a gran escala y con cobertura temporal. En contraste, grandes cantidades de fondos, métodos complejos y programas nacionales de monitoreo genético están concentrados en países bien desarrollados, y los resultados están proporcionando herramientas poderosas tanto para la gestión de especies como para la conservación a largo plazo.