El Cerrado comprende una de las sabanas más diversas del mundo y está experimentando una rápida pérdida de hábitats debido a los cambios en los regímenes de incendios y la intensa conversión de áreas nativas a la agricultura. Revisamos datos sobre el funcionamiento biogeoquímico de los ecosistemas del Cerrado y evaluamos los posibles impactos de los cambios climáticos regionales. La variación en las temperaturas extremas, la cantidad total de lluvia y la altitud en todo el Cerrado determina marcadas diferencias en la composición de las especies. Los ecosistemas del Cerrado están controlados por las interacciones entre el agua y la disponibilidad de nutrientes. En general, los ciclos de nutrientes (N, P y cationes básicos) son muy conservadores, mientras que la hojarasca, la biomasa microbiana y vegetal son reservas importantes. En cuanto al ciclo del carbono, los sistemas radiculares y, especialmente, la materia orgánica del suelo son las reservas más importantes. Los ecosistemas típicos del Cerrado funcionan como sumideros de carbono anualmente, aunque también actúan como fuente de carbono a la atmósfera cerca del final de la estación seca. El fuego es un factor importante que altera las reservas y los flujos de carbono y nutrientes. Los cambios previstos en la temperatura, la cantidad y la distribución de las precipitaciones varían según las subregiones del Cerrado, con cambios más marcados en la parte noreste del dominio. El aumento de las temperaturas y la disminución de las precipitaciones, junto con el aumento de la duración de la estación seca, podrían desplazar los intercambios netos de carbono en los ecosistemas, de ser sumidero a fuente de carbono, y podrían intensificar la quema, reduciendo así las reservas de nutrientes. Las interacciones entre la heterogeneidad en la composición y abundancia de las comunidades biológicas en todo el Dominio del Cerrado y los cambios actuales y futuros en el uso del suelo dificultan la proyección de los impactos de futuros escenarios climáticos a diferentes escalas temporales y espaciales, por lo que se necesitan nuevos enfoques de modelado.