La inoculación microbiana juega un papel crucial en la formación de las respuestas fisiológicas y bioquímicas de las plantas, influyendo en el crecimiento, el metabolismo secundario y los marcadores relacionados con el estrés. Este estudio investiga los efectos de microorganismos degradadores de PAH en el crecimiento, el metabolismo secundario, los pigmentos fotosintéticos y los marcadores bioquímicos relacionados con el estrés de plántulas de abedul plateado de dos familias medio-hermanas cultivadas hidropónicamente. Los resultados demuestran variaciones dependientes de la familia en la respuesta a los tratamientos microbianos. En la familia 73, el crecimiento tanto de los brotes como de las raíces fue inhibido por ciertos tratamientos microbianos, junto con una disminución en marcadores bioquímicos clave como el contenido fenólico y los carotenoides. Por el contrario, la familia 86 no mostró inhibición del crecimiento y exhibió mejoras en algunos marcadores bioquímicos, incluidos los flavonoides y la clorofila. Los indicadores de estrés, como el malondialdehído (MDA) y los azúcares solubles, mostraron patrones contrastantes entre las familias, con un aumento de MDA observado en la familia 73 bajo ciertos tratamientos microbianos. En contraste, la familia 86 no mostró un aumento en MDA, lo que sugiere diferencias en la mitigación del estrés. Los azúcares solubles se redujeron generalmente en la familia 73. La actividad de las enzimas antioxidantes destacó aún más estas respuestas específicas de la familia, con variaciones en enzimas como la ascorbato peroxidasa (APX) y la guaiacol peroxidasa (POX) a través de los tratamientos. Notablemente, se observaron interacciones significativas entre la familia y los tratamientos microbianos para varias enzimas de estrés oxidativo, subrayando el papel del genotipo en la formación de la respuesta al estrés microbiano. Estos hallazgos destacan las interacciones dependientes del genotipo entre la inoculación microbiana y el metabolismo secundario de las plantas, proporcionando información sobre el papel de la inoculación microbiana seleccionada específicamente en la mitigación del estrés y la regulación del crecimiento.