Desde la llegada de la enfermedad de Huanglongbing (HLB), la producción de cítricos de Florida ha disminuido en un 70%. Los árboles afectados por HLB declinan rápidamente en condiciones de crecimiento de alto pH. La disponibilidad limitada de nutrientes en un pH del suelo alto se ha especulado como la causa de tal declive rápido en árboles afectados por HLB; sin embargo, tal declive no se observa en árboles de cítricos sanos. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue comprender la absorción de nutrientes, las respuestas fisiológicas y moleculares de árboles de naranja dulce sanos (HLY) y afectados por HLB (HLB) cuando se cultivan en medios mantenidos a diferentes niveles de pH 6.0, 7.0 u 8.0. En general, el rendimiento de los árboles HLY y HLB disminuyó con el aumento de las condiciones de pH. Los árboles HLB mostraron una correlación inversa significativa entre los parámetros de crecimiento (número de hojas, crecimiento de brotes, valor SPAD, potencial hídrico de tallos) y el pH del medio de cultivo, mientras que no se observó tal correlación en los árboles HLY. Curiosamente, el rendimiento superior de los árboles HLB a pH 6.0 coincidió con una mayor acumulación de Fe, Mn y N en todo el cuerpo de la planta en comparación con los tratamientos de pH alto. En contraste, el rendimiento del árbol HLY fue significativamente mejor a pH 7.0 en comparación con otras condiciones de pH. A pH 7.0, los genes relacionados con el estrés se sobreexpresaron en las hojas de HLB en comparación con las hojas de HLY, lo que indica que la respuesta al estrés en términos de abscisión de hojas, crecimiento reducido y proceso natural de envejecimiento se exacerbó en los árboles HLB en tratamientos de pH más altos. En conjunto, todas las observaciones fisiológicas y moleculares respaldan una interacción entre los árboles HLB y el pH, donde los árboles HLB a pH 6.0 tienen un mejor rendimiento que a pH más alto.