Antecedentes: El trasplante de células madre alogénicas (aSCT) es un tratamiento común para una variedad de enfermedades hematológicas. Los avances en las prácticas de trasplante han llevado a un número creciente de sobrevivientes a largo plazo de aSCT, pero los datos sobre el estado de salud y las complicaciones tardías son escasos. Este análisis se centra en la función renal y las complicaciones urológicas en esta población. Métodos: Este estudio es un ensayo no intervencionista unicéntrico prospectivo. Antes de comenzar el estudio, obtuvimos la aprobación del comité de ética local. Además, el estudio fue registrado en el Registro de Ensayos Clínicos de la OMS. El protocolo del estudio está disponible a través de UTN. Resultados: Pudimos incluir a 33 pacientes con una edad media de 60.5 años (DE 11.1). El tiempo medio de supervivencia tras el trasplante de células madre alogénicas fue de 9.0 años (IQR 8.5-13.0). Cinco pacientes (15.2%) presentaron viruria por BKPyV con una media de 218.3 (DE 674.2) copias/mL. La viruria por BKPyV se vinculó significativamente a la insuficiencia renal crónica preexistente (p = 0.019), creatinina > 100 umol/L (p < 0.001) y cistatina c > 1.11 mg/L (p = 0.021), respectivamente. No pudimos identificar un solo factor de riesgo para la viruria por BKPyV en la regresión de Cox univariada o multivariada. Conclusiones: La nefropatía asociada a BKPyV podría ser una de las razones de la función renal deteriorada en los sobrevivientes a largo plazo de aSCT.