La alteración hidrológica de los sistemas fluviales es un factor esencial de la actividad humana. Las aguas de embalses en cascada se caracterizan por el flujo perturbado de material desde la cuenca. Los cambios en el sedimento, la carga disuelta y el equilibrio de nutrientes se encuentran entre los indicadores básicos del monitoreo de recursos hídricos. Esta investigación se basó en el uso de datos hidrológicos y de calidad del agua (1984-2017) y el método de Indicadores de Alteración Hidrológica (IHA) para determinar la influencia de los cambios en el régimen fluvial sobre la continuidad del transporte de sedimentos y nutrientes aguas abajo, en el ejemplo de los embalses en cascada del río Brda inferior (Polonia). Se utilizaron dos tipos de regímenes: hidropeaking (1984-2000) y run-of-river (2001-2017). Utilizando el método IHA y datos de calidad del agua, se demostró una relación cualitativa y cuantitativa entre los cambios en el funcionamiento del régimen y el equilibrio de sedimentos y nutrientes. El uso de sitios por encima y por debajo de la cascada permitió determinar los procesos de retención y eliminación de sedimentos, carga disuelta y nutrientes. Los estudios han demostrado que los cambios en el régimen de operación influyeron en la cadena de suministro y la continuidad del transporte de sedimentos y nutrientes en ríos con embalses en cascada. La investigación realizada mostró que la gestión sostenible de sedimentos y nutrientes en la cuenca alterada ayuda a lograr un buen estado ecológico del agua.