El almacenamiento temporal de concentrados de algas húmedas permite el desacoplamiento en el tiempo de las cosechas de algas y su biorrefinería. Sin embargo, el impacto del cultivo y de las condiciones de cosecha en la calidad de las algas durante la conservación es en gran parte desconocido. Este estudio tuvo como objetivo determinar el impacto de la limitación de nutrientes y de los métodos de cosecha en la preservación de la biomasa. Las algas fueron alimentadas adecuadamente hasta la cosecha o no recibieron nutrientes durante una semana, y fueron cosechadas ya sea por centrifugación en lotes o continua. Se monitorearon la formación de ácidos orgánicos, los niveles de lípidos y la lipólisis. La limitación de nutrientes tuvo un gran impacto y resultó en valores de pH más bajos (4,9 +/- 0,4), altos niveles de ácido láctico y ácido acético, y un grado ligeramente mayor de hidrólisis de lípidos. Los concentrados de algas bien alimentadas tenían un pH más alto (7,4 +/- 0,2) y otro patrón de productos de fermentación con principalmente ácido acético, ácido succínico y, en menor medida, ácido láctico y ácido propiónico. El efecto del método de cosecha fue menor, con niveles de ácido láctico y ácido acético más altos para las algas cosechadas por centrifugación continua que para las obtenidas por centrifugación en lotes. En conclusión, la limitación de nutrientes, un método conocido para mejorar los niveles de lípidos de las algas, puede impactar en varios atributos de calidad de las algas durante su almacenamiento húmedo.