La labranza de conservación y la fertilización son ampliamente adoptadas en los sistemas agrícolas para mejorar la fertilidad del suelo e influir en las comunidades fúngicas, mejorando así los agroecosistemas. Sin embargo, los efectos de la labranza cero combinada con estiércol en el rendimiento de grano, la eficiencia en el uso de nitrógeno (NUE), la fertilidad del suelo y las comunidades fúngicas de la rizosfera siguen siendo poco comprendidos, particularmente en campos de trigo de secano en la Meseta Loess. Se llevó a cabo un experimento de campo de 15 años en la Granja Experimental Niujiawa del Instituto de Investigación del Algodón, Universidad Agrícola de Shanxi. Se evaluaron cinco tratamientos: labranza convencional sin fertilizante (C), labranza cero con fertilizante químico (NT), labranza cero con fertilizante químico y estiércol (NTM), labranza convencional con fertilizante químico (T) y labranza convencional con fertilizante químico y estiércol (TM). Los resultados demostraron que el tratamiento NTM aumentó significativamente el rendimiento de grano en un 124.95%, NT en un 65.88%, TM en un 68.97% y T en un 41.75%, en comparación con el tratamiento C (< 0.05). La NUE en el tratamiento NTM mejoró entre un 58.73% y un 200.59%. En comparación con el tratamiento C, NTM mejoró significativamente los nutrientes del suelo, incluyendo materia orgánica (OM) en un 70.68%, nitrógeno total (TN) en un 8.81%, fósforo total (TP) en un 211.53%, nitrógeno disponible (AN) en un 90.00%, fósforo disponible (AP) en un 769.12% y potasio disponible (AK) en un 89.01%. Además, el tratamiento NTM alteró la comunidad fúngica de la rizosfera del trigo de invierno, siendo (81.36%-90.24%) el filo dominante, seguido por (5.40%-12.83%) y (1.50%-8.53%). A nivel de género, NTM aumentó significativamente la abundancia de y . Un análisis de alfa-diversidad reveló que la riqueza y diversidad de los hongos del suelo fueron más altas bajo NTM. El método de agrupamiento por pares no ponderados con media aritmética (UPGMA) y el análisis de coordenadas principales (PCoA) basado en distancias de Bray-Curtis indicaron que NTM formó una comunidad fúngica distinta con la mayor diversidad filogenética, que difería significativamente de otros tratamientos. El análisis de redundancia (RDA) demostró que las propiedades químicas del suelo influenciaron de manera variable la dinámica de la comunidad fúngica, con mayores abundancias de y correlacionadas positivamente con OM, AN, AP, TP y AK. El análisis de correlación mostró que el rendimiento del trigo y la NUE estaban correlacionados positivamente con y , y negativamente con , , y . En conclusión, la labranza cero con estiércol no solo mejoró la fertilidad del suelo, sino que también mejoró la estructura de la comunidad fúngica del suelo, lo que llevó a un mayor rendimiento de trigo y NUE. Estos hallazgos proporcionan orientación para las prácticas agrícolas en campos de trigo de secano de la Meseta Loess.