Los efectos combinados de labranza y enmiendas orgánicas en la respiración microbiana y su contribución a la conductividad hidráulica del suelo siguen siendo inciertos en la capa de 0-40 cm de un suelo loésico. Llevamos a cabo un experimento de campo de dos años para explorar los efectos de las enmiendas orgánicas, la labranza y su interacción en la respiración microbiana del suelo, la estabilidad de los agregados, los parámetros de poros y la conductividad hidráulica en la meseta de loess. Tres métodos de labranza (labranza convencional (CT), labranza profunda (DT) y no labranza (NT)) más cinco tratamientos de fertilizantes (fertilizante mineral (control) solo y junto con 20 t ha paja de trigo (MWS), cascarilla de trigo (MWH), estiércol de corral (MFS) y fertilizante bioorgánico (MBF)) se establecieron como tratamientos experimentales. Los hallazgos demostraron que las enmiendas orgánicas aumentaron significativamente la respiración microbiana del suelo y la conductividad hidráulica saturada en comparación con el control en las capas de 0-10 cm y 10-20 cm. La respiración microbiana del suelo tuvo efectos indirectos en la conductividad hidráulica al mejorar la estabilidad de los agregados de agua y la macroporosidad. Además, los efectos de interacción de la labranza y las enmiendas orgánicas en los parámetros de poros e hidrológicos fueron significativos en la capa de 20-40 cm. NT-MBF resultó en la mayor conductividad hidráulica saturada, que se correlacionó directamente con la fuerte organización de poros del suelo. Dada la cuestión de la compactación del suelo subsuperficial en nuestra área de estudio, se recomienda que los agricultores locales adopten NT-MBF para mejorar las propiedades microbianas, estructurales e hidrológicas del suelo.