El presente estudio investigó el efecto de una baja densidad de población en el crecimiento, la supervivencia, los parámetros de alimentación y las respuestas fisiológicas (metabolitos en sangre, indicadores de bienestar, biomarcadores inmunes y respuestas transcriptómicas de genes relacionados con el estrés y la inmunidad) en truchas arcoíris juveniles criadas en un sistema de acuicultura en recirculación durante 12 semanas. Los peces (peso promedio de 29.64 g) fueron criados en triplicado bajo cuatro densidades iniciales: nueve peces por tanque (D9, 3.76 +/- 0.06 kg/m), 18 peces por tanque (D18, 7.66 +/- 0.18 kg/m), 27 peces por tanque (D27, 9.67 +/- 0.01 kg/m) y 36 peces por tanque (D36, 12.94 +/- 0.14 kg/m). Los resultados mostraron que una menor densidad de población D9 alteró significativamente la supervivencia, con varios peces muriendo durante el experimento y una alteración del crecimiento y la eficiencia alimentaria de los peces restantes. Paralelamente, el estudio reveló que la baja densidad de población inducía un estrés crónico que alteraba las respuestas fisiológicas de las truchas mediante la desregulación de los niveles cerebrales de inflamación, del sistema inmunológico y de indolamina/catecolamina. En conclusión, respecto a todas las variables observadas, la baja densidad de población (D9) altera la supervivencia, el crecimiento y la eficiencia alimentaria de la trucha arcoíris con alteración de sus respuestas fisiológicas. Seleccionar una densidad de peces adecuada en relación con las condiciones de crianza resultó ser una preocupación esencial para mejorar el bienestar en un contexto de acuicultura.