La selección genómica (GS) se ha utilizado ampliamente en la cría de ganado. Sin embargo, el impacto a largo plazo de la GS en la ganancia genética, así como en los niveles de endogamia, no ha sido completamente explorado en el ganado de carne. En este estudio, llevamos a cabo un análisis de simulación utilizando diferentes enfoques que involucran dos tipos de densidad de SNP (54 K y 100 K) y tres niveles de heredabilidad de rasgos (h = 0.1, 0.3 y 0.5) para explorar los efectos a largo plazo de las estrategias de selección en la ganancia genética y los coeficientes de parentesco promedio. Nuestros resultados mostraron que la GS puede mejorar la ganancia genética a lo largo de las generaciones, y la estrategia GBLUP mostró un rendimiento ligeramente mejor que el modelo BayesA. Una heredabilidad de rasgo más alta puede generar una mayor ganancia genética en todos los escenarios. Además, los resultados de la simulación utilizando las estrategias GBLUP y BayesA mostraron coeficientes de parentesco promedio más altos en comparación con otras estrategias. Nuestro estudio sugirió que es importante diseñar estrategias de GS considerando la densidad de SNP y la heredabilidad del rasgo para lograr una ganancia genética a largo plazo y sostenible y controlar efectivamente los niveles de endogamia.