Este estudio investigó los efectos de las enmiendas orgánicas (retorno de paja, fertilizante orgánico, biochar y sus combinaciones) en el rendimiento del grano, la calidad y las características bioquímicas del suelo en trigo negro. Un experimento de campo de dos años (2022-2024) se llevó a cabo con cinco tratamientos: F (fertilización convencional), FS (F + retorno completo de paja), FO (F + 3 t/ha de fertilizante orgánico), FB (F + 3 t/ha de biochar) y FSOB (F + paja completa + 3 t/ha de fertilizante orgánico + 3 t/ha de biochar). FSOB logró el rendimiento más alto, aumentando en un 17.3% sobre F debido a un mayor número de espigas y peso de 1000 granos. La proteína del grano aumentó un 9.0% y un 9.4% bajo FS y FO, respectivamente. La adición de paja también elevó el gluten en un 6.8%. El análisis del suelo reveló que la gestión orgánica integrada aumentó significativamente los contenidos de materia orgánica (en un 23.1%), nitrógeno total (en un 46.0%) y fósforo disponible (en un 73.5%) en la capa de suelo de 0-20 cm. También promovió taxones microbianos beneficiosos, incluyendo Actinobacteria (+11.2%) y Proteobacteria (+0.6%), en comparación con la fertilización convencional. Estos hallazgos sugieren que la integración estratégica de enmiendas orgánicas puede mejorar la productividad y calidad del trigo negro al mejorar la fertilidad del suelo y la funcionalidad microbiana, apoyando así sistemas de cultivo sostenibles.