El objetivo de este estudio fue emplear un algoritmo diagnóstico, que implica detectar granjas positivas mediante PCR en heces seguido de PCR e histología/inmunohistoquímica en muestras de íleon, para diagnosticar enteritis proliferativa en el norte de Italia. El objetivo principal fue examinar la relación entre el estándar de oro de los diagnósticos, a saber, la histología y la inmunohistoquímica, y la PCR en casos agudos y crónicos de enteritis. Un objetivo adicional fue investigar la coinfección con el circovirus porcino tipo 2 (PCV2). Se recolectaron veintiocho muestras de íleon, incluyendo cuatro de casos agudos y 24 de casos crónicos. La PCR arrojó resultados positivos en 19 casos (cuatro agudos y 15 crónicos). En comparación, la inmunohistoquímica fue positiva en 16 casos (cuatro agudos y 12 crónicos), con un acuerdo observado del 89%. Los hallazgos sugieren que realizar las dos pruebas en serie puede aumentar la especificidad del diagnóstico causal. La PCR puede utilizarse como una herramienta de detección para identificar la presencia del microorganismo, y solo los casos positivos serán examinados por histología e inmunohistoquímica para confirmar el papel causante. La coinfección con PCV2 se demostró en dos de cuatro casos agudos y en dos de 24 casos crónicos, proporcionando más evidencia para apoyar la hipótesis de que cuando la infección comienza con patógenos ubicuos, puede aumentar la posibilidad de replicación del PCV2, especialmente en casos agudos. Como resultado, esto puede desencadenar una transición de formas subclínicas a clínicas de la enfermedad por PCV2.