Iiivmrmlm proporciona nuevas ideas sobre la base genética de la variación de rasgos agronómicos en garbanzo
Autores: Duk, Maria; Kanapin, Alexander; Orlova, Ekaterina; Samsonova, Maria
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Iiivmrmlm proporciona nuevas ideas sobre la base genética de la variación de rasgos agronómicos en garbanzo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Garbanzo
Interacciones genotipo-por-ambiente
QTNs
Variedades locales
Alelos
Adaptativo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
El garbanzo es un cultivo básico para muchas naciones en todo el mundo. Modelar las interacciones genotipo-por-ambiente y evaluar la capacidad del genotipo para contribuir con alelos adaptativos son cruciales para la crianza de garbanzos. En este estudio, evaluamos 12 rasgos agronómicamente importantes de 159 accesiones de la colección del Instituto de Recursos Genéticos Vegetales N.I. Vavilov de Rusia. Estas incluyeron 145 variedades locales y 13 cultivares cultivados en diferentes condiciones climáticas en Kuban (45 grados 18 N y 40 grados 52 E) en 2016 y 2022, así como en Astracán (46 grados 06 N y 48 grados 04 E) en 2022. Usando el modelo IIIVmrMLM en modo multiambiental, identificamos 161 nucleótidos de rasgos cuantitativos (QTNs) con efectos genéticos estables en diferentes ambientes. Además, observamos 254 interacciones QTN-por-ambiente con efectos específicos del ambiente. Notablemente, cinco de estas interacciones manifestaron grandes efectos, con valores de R superiores al 10%, mientras que el valor de R más alto para los QTN estables fue del 4.7%. Dentro de los genes codificadores de proteínas y sus regiones flanqueantes de 1 Kb, distinguimos 22 QTNs y 45 interacciones QTN-por-ambiente, probablemente etiquetando los genes causales candidatos. Las variedades locales obtenidas de la colección del Instituto de Recursos Genéticos Vegetales N.I. Vavilov de Rusia exhiben numerosos alelos favorables en los loci de nucleótidos de rasgos cuantitativos, mostrando efectos estables en las regiones de Kuban y Astracán. Además, poseían un número significativamente mayor de alelos favorables específicos de Kuban de los loci de interacción QTN-por-ambiente en comparación con los de Astracán. Los alelos específicos del ambiente encontrados en los loci de interacción QTN-por-ambiente tienen el potencial de mejorar la adaptación del garbanzo a condiciones climáticas específicas.
Descripción
El garbanzo es un cultivo básico para muchas naciones en todo el mundo. Modelar las interacciones genotipo-por-ambiente y evaluar la capacidad del genotipo para contribuir con alelos adaptativos son cruciales para la crianza de garbanzos. En este estudio, evaluamos 12 rasgos agronómicamente importantes de 159 accesiones de la colección del Instituto de Recursos Genéticos Vegetales N.I. Vavilov de Rusia. Estas incluyeron 145 variedades locales y 13 cultivares cultivados en diferentes condiciones climáticas en Kuban (45 grados 18 N y 40 grados 52 E) en 2016 y 2022, así como en Astracán (46 grados 06 N y 48 grados 04 E) en 2022. Usando el modelo IIIVmrMLM en modo multiambiental, identificamos 161 nucleótidos de rasgos cuantitativos (QTNs) con efectos genéticos estables en diferentes ambientes. Además, observamos 254 interacciones QTN-por-ambiente con efectos específicos del ambiente. Notablemente, cinco de estas interacciones manifestaron grandes efectos, con valores de R superiores al 10%, mientras que el valor de R más alto para los QTN estables fue del 4.7%. Dentro de los genes codificadores de proteínas y sus regiones flanqueantes de 1 Kb, distinguimos 22 QTNs y 45 interacciones QTN-por-ambiente, probablemente etiquetando los genes causales candidatos. Las variedades locales obtenidas de la colección del Instituto de Recursos Genéticos Vegetales N.I. Vavilov de Rusia exhiben numerosos alelos favorables en los loci de nucleótidos de rasgos cuantitativos, mostrando efectos estables en las regiones de Kuban y Astracán. Además, poseían un número significativamente mayor de alelos favorables específicos de Kuban de los loci de interacción QTN-por-ambiente en comparación con los de Astracán. Los alelos específicos del ambiente encontrados en los loci de interacción QTN-por-ambiente tienen el potencial de mejorar la adaptación del garbanzo a condiciones climáticas específicas.