Cuando se obtienen nuevos cultivares o se monitorea la composición nutricional de la lechuga, son necesarias nuevas técnicas dadas el alto costo y tiempo requerido para realizar análisis de laboratorio de la composición de plantas por métodos convencionales. El objetivo de este estudio fue evaluar diferentes índices de vegetación para la estimación de antocianinas, clorofila y carotenoides en genotipos de mini-lechuga con diferentes colores de hojas y diferentes tipologías a partir de imágenes rojas, verdes y azules (RGB). Los contenidos de pigmentos fueron evaluados en 15 genotipos de lechuga, además del índice de desarrollo del análisis de planta de suelo (SPAD) e índices de vegetación en el rango visible. La variabilidad entre genotipos fue confirmada por la prueba de Scott-Knott ( < 0.05) y análisis multivariado. Se obtuvieron regresiones lineales entre el índice de hoja verde (GLI) y los pigmentos de las hojas. GLI fue un buen predictor para estimar los contenidos de antocianinas (r = -0.83; r = 0.75), carotenoides (r = -0.59; r = 0.43), clorofila a (r = -0.69; r = 0.48), clorofila b (r = -0.62; r = 0.39) y clorofila total (r = -0.77; r = 0.65) en mini-lechugas rojas y verdes. La técnica de fenotipado de alto rendimiento puede ser utilizada para evaluar pigmentos de hojas en programas de mejoramiento, así como en cultivos para monitorear niveles de biofortificación en la lechuga.