El útero es un órgano crítico para el embarazo en los mamíferos. El crecimiento y desarrollo normal de los carúnculos uterinos en rumiantes son cruciales para mantener la gestación y la salud fetal en las cabras. La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) es una herramienta confiable para estudiar el perfil de expresión génica y explorar el mecanismo intrínseco subyacente al proceso de conversión del tejido de carúnculo uterino. Sin embargo, se requieren genes de referencia candidatos (HKGs) para normalizar la expresión de los genes funcionales. En nuestro estudio, se seleccionaron 22 HKGs a partir del análisis de datos de transcriptoma en procesos de no embarazo y embarazo, así como de informes previos sobre HKGs en tejidos de cabra. Evaluamos su idoneidad de expresión en 24 muestras de tejidos uterinos en 15 días no embarazados (Etapa 1), días de embarazo temprano (Etapa 2) y días de embarazo medio-tardío (Etapa 3). La estabilidad de expresión de estos genes se evaluó utilizando los algoritmos geNorm, Normfinder, Bestkeeper y Delta Ct, y de manera integral, mediante ReFinder. Además, los HKGs más y menos estables se utilizaron para normalizar la expresión de los genes objetivo de , , y . Se encontró que los genes de referencia tradicionales, como y , no eran adecuados para la normalización de los genes objetivo. En contraste, seleccionados de datos de secuenciación de ARN y seleccionados de referencias anteriores mostraron la menor variación y se recomendaron como los mejores HKGs durante la etapa no embarazada y en todas las etapas del tejido de carúnculo uterino de cabra, respectivamente. Es la primera vez que se han explorado los genes HKGs en el útero durante el día no embarazado y a lo largo de todo el embarazo. Estos hallazgos encontraron HKGs adecuados en los tejidos de carúnculo uterino en varias etapas de no embarazo y embarazo; estos pueden ser útiles para estudios de expresión génica que revelen los mecanismos moleculares del desarrollo uterino en cabras.