Definiendo genes de referencia adecuados para qRT-PCR en (Coleoptera: Chrysomelidae) bajo diferentes condiciones bióticas o abióticas
Autores: Tu, Chengjie; Xu, Pei; Han, Runhua; Luo, Jing; Xu, Letian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Definiendo genes de referencia adecuados para qRT-PCR en (Coleoptera: Chrysomelidae) bajo diferentes condiciones bióticas o abióticas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Plagas destructivas
Salicaceae
Mecanismos moleculares
Genes de referencia
Análisis de expresión génica
Interacciones antagonistas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
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Citaciones: Sin citaciones
(Coleoptera: Chrysomelidae) es una de las plagas más destructivas de las Salicaceae en todo el mundo, que ha establecido interacciones complejas con organismos circundantes. Descubrir los mecanismos moleculares de algunas interacciones antagonistas facilitaría el desarrollo de estrategias de manejo de insectos plaga respetuosas con el medio ambiente. Los genes de referencia adecuados son esenciales para un análisis fiable de qPCR y expresión génica en estudios moleculares; sin embargo, aún falta una evaluación exhaustiva de los genes de referencia en . En este estudio, se investigó la estabilidad de siete genes de referencia (incluyendo , , -, , , y ) bajo condiciones bióticas (etapas de desarrollo, tejidos, sexo y tratamiento con patógenos) y abióticas (tratamiento de interferencia de ARN, tratamiento de temperatura). Se utilizaron los programas geNorm, NormFinder, BestKeeper y Ct para analizar los datos de expresión génica. Se aplicó el análisis de síntesis RefFinder para sugerir un puñado de genes de referencia apropiados para cada condición experimental. y fueron los genes de referencia más fiables en diferentes etapas de desarrollo; y fueron los más estables en adultos hembra y macho, diferentes tejidos, diferentes temperaturas y tratamiento con patógenos; - y fueron los más estables después del tratamiento con ARNi dietético. La investigación proporciona una base sólida para futuras investigaciones sobre la biología molecular de .
Descripción
(Coleoptera: Chrysomelidae) es una de las plagas más destructivas de las Salicaceae en todo el mundo, que ha establecido interacciones complejas con organismos circundantes. Descubrir los mecanismos moleculares de algunas interacciones antagonistas facilitaría el desarrollo de estrategias de manejo de insectos plaga respetuosas con el medio ambiente. Los genes de referencia adecuados son esenciales para un análisis fiable de qPCR y expresión génica en estudios moleculares; sin embargo, aún falta una evaluación exhaustiva de los genes de referencia en . En este estudio, se investigó la estabilidad de siete genes de referencia (incluyendo , , -, , , y ) bajo condiciones bióticas (etapas de desarrollo, tejidos, sexo y tratamiento con patógenos) y abióticas (tratamiento de interferencia de ARN, tratamiento de temperatura). Se utilizaron los programas geNorm, NormFinder, BestKeeper y Ct para analizar los datos de expresión génica. Se aplicó el análisis de síntesis RefFinder para sugerir un puñado de genes de referencia apropiados para cada condición experimental. y fueron los genes de referencia más fiables en diferentes etapas de desarrollo; y fueron los más estables en adultos hembra y macho, diferentes tejidos, diferentes temperaturas y tratamiento con patógenos; - y fueron los más estables después del tratamiento con ARNi dietético. La investigación proporciona una base sólida para futuras investigaciones sobre la biología molecular de .