El azafrán (L.) presenta una oportunidad atractiva para diversificar la producción y agregar valor, particularmente para los agricultores a pequeña escala y la agricultura familiar. Sin embargo, la propagación agámica del cultivo a través de cormos plantea preocupaciones sobre la dispersión de enfermedades. Durante los veranos de 2013 y 2015, se observaron síntomas de pudrición de cormos en cultivos de azafrán en La Consulta, Valle de Uco, Argentina. Estos síntomas se manifestaron en forma de plantas marchitas y áreas de color rojo en la superficie de los cormos, afectando en algunos casos regiones más profundas. Este estudio tuvo como objetivo aislar e identificar el agente causal responsable de la pudrición de cormos de azafrán, además de comparar la virulencia de cuatro cepas aisladas en plantas de azafrán. El aislamiento consistente de colonias de spp. de cormos afectados confirmó su asociación con la enfermedad. Los aislamientos obtenidos fueron inoculados en cormos sanos, y se confirmó la reproducción de síntomas, así como la posterior reaislación del patógeno. Se realizó una caracterización morfológica y molecular de las cepas utilizando secuenciación del gen rDNA. Además, se evaluó la progresión de la enfermedad ajustando modelos epidemiológicos a datos empíricos, que sirvieron como estimadores de la agresividad de las cepas fúngicas. Los resultados identificaron de manera concluyente a Schltdl. como el agente causal de la pudrición de cormos, y se observaron variaciones en la virulencia entre las cepas en la planta huésped. Después de estudios moleculares y patológicos básicos, se postula que las cepas fúngicas posiblemente pertenecen a la forma especialis, pero se necesitan más estudios para confirmarlo. El presente estudio proporciona hallazgos que destacan la importancia de la detección temprana y la preservación de campos libres de patógenos para sostener el cultivo de azafrán. Estos hallazgos pueden constituir el primer paso para futuros proyectos destinados a comprender mejor la epidemiología de la enfermedad, determinar las especies/razas del patógeno y desarrollar estrategias de manejo efectivas.