Identificación y validación de eRNA como un indicador pronóstico para el cáncer de cuello uterino
Autores: Huang, Lijing; Zhang, Jingkai; Songyang, Zhou; Xiong, Yuanyan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación y validación de eRNA como un indicador pronóstico para el cáncer de cuello uterino
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Supervivencia
EARN
Análisis
Modelo
Puntuación de riesgo
Pacientes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
La supervivencia de los pacientes con CESC está estrechamente relacionada con la expresión de ARN potenciador (eRNA). En este trabajo, descargamos datos de expresión de eRNA, clínicos y de expresión génica de los portales TCeA y TCGA. Se descubrieron un total de 7936 eRNAs expresados diferencialmente mediante análisis limma, y se analizó la relación entre estos eRNAs y la supervivencia mediante análisis de riesgo de Cox univariado, regresión LASSO y análisis de riesgo de Cox multivariado para obtener un modelo de 8-eRNA. Los mapas de calor de puntuación de riesgo, las curvas KM, el análisis ROC, el análisis de robustez y los nomogramas indican además que este modelo de 8-eRNA es un nuevo indicador con un alto rendimiento pronóstico independiente de la clasificación clinicopatológica. El modelo dividió a los pacientes en grupos de alto y bajo riesgo, comparó la diversidad de vías entre los dos grupos a través del análisis GSEA y proporcionó agentes terapéuticos potenciales para los pacientes de alto riesgo.
Descripción
La supervivencia de los pacientes con CESC está estrechamente relacionada con la expresión de ARN potenciador (eRNA). En este trabajo, descargamos datos de expresión de eRNA, clínicos y de expresión génica de los portales TCeA y TCGA. Se descubrieron un total de 7936 eRNAs expresados diferencialmente mediante análisis limma, y se analizó la relación entre estos eRNAs y la supervivencia mediante análisis de riesgo de Cox univariado, regresión LASSO y análisis de riesgo de Cox multivariado para obtener un modelo de 8-eRNA. Los mapas de calor de puntuación de riesgo, las curvas KM, el análisis ROC, el análisis de robustez y los nomogramas indican además que este modelo de 8-eRNA es un nuevo indicador con un alto rendimiento pronóstico independiente de la clasificación clinicopatológica. El modelo dividió a los pacientes en grupos de alto y bajo riesgo, comparó la diversidad de vías entre los dos grupos a través del análisis GSEA y proporcionó agentes terapéuticos potenciales para los pacientes de alto riesgo.