La altura de la planta es un rasgo agronómico clave en la soja, que influye directamente en el potencial de rendimiento y el desempeño agronómico. En este estudio, el cultivar de tallo alto Heinong 63 y el cultivar de tallo enano Longken 3077, junto con sus poblaciones F, se utilizaron como materiales experimentales. Un mapeo preliminar utilizando el enfoque de secuenciación de análisis de segregantes a granel (BSA-Seq) nos permitió localizar el locus objetivo dentro de un intervalo de 1,8 Mb, que posteriormente se redujo a una región de 48,3 kb utilizando marcadores de repetición de secuencia simple (SSR) e inserción y deleción (InDel). El intervalo se designó como PH19-31 y contenía nueve genes anotados. Se desarrolló un marcador InDel, PL7, dentro de esta región finamente mapeada. Basándonos en un análisis de expresión de los nueve genes candidatos, se identificaron como posibles reguladores de la altura de la planta en la soja. Este estudio proporciona materiales valiosos y soporte técnico para la clonación de genes relacionados con la altura de la planta y la mejora molecular de la soja.