Identificación de la familia de genes del transportador de potasio de alta afinidad (HKT) en especies del triángulo U y sus posibles roles en el estrés abiótico en L
Autores: Yang, Xiaoran; Hu, Ran; Sun, Fujun; Shen, Shulin; Zhang, Mengzhen; Liu, Yiwei; Zhang, Yi; Du, Hai; Lu, Kun; Qu, Cunmin; Yin, Nengwen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de la familia de genes del transportador de potasio de alta afinidad (HKT) en especies del triángulo U y sus posibles roles en el estrés abiótico en L
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transportador de potasio de alta afinidad
Familia HKT
Estrés abiótico
Colza
Relaciones filogenéticas
Estrés por metales pesados
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los miembros de la familia de proteínas transportadoras de potasio de alta afinidad (HKT) regulan la absorción y homeostasis de iones de sodio y potasio, pero se ha investigado poco sobre sus roles en respuesta a estrés abiótico en colza (L.). En este estudio, identificamos y caracterizamos un total de 36 genes de las especies que comprenden el triángulo de U (especies del triángulo U): , , , , , y . Analizamos las relaciones filogenéticas, las estructuras génicas, las composiciones de motivos y las distribuciones cromosómicas de los miembros de la familia HKT de la colza. Basándonos en sus relaciones filogenéticas y la agrupación de dominios funcionales, clasificamos a los miembros de HKT en cuatro subgrupos, HKT1;1 a HKT1;4. El análisis de las sustituciones no sinónimas (Ka), sustituciones sinónimas (Ks) y las proporciones Ka/Ks de pares de genes sugiere que estos genes han experimentado una fuerte presión selectiva purificadora después de la duplicación, con sus relaciones evolutivas apoyando la teoría del triángulo U. Además, los perfiles de expresión de los genes varían entre el tratamiento con potasio, fitohormonas y metales pesados. Su represión proporciona resistencia al estrés por metales pesados, posiblemente limitando la absorción. Nuestros resultados revelan sistemáticamente las características de las proteínas de la familia HKT y sus genes codificadores en seis especies y sientan una base para una exploración más profunda del papel de los genes de la familia en la tolerancia a metales pesados.
Descripción
Los miembros de la familia de proteínas transportadoras de potasio de alta afinidad (HKT) regulan la absorción y homeostasis de iones de sodio y potasio, pero se ha investigado poco sobre sus roles en respuesta a estrés abiótico en colza (L.). En este estudio, identificamos y caracterizamos un total de 36 genes de las especies que comprenden el triángulo de U (especies del triángulo U): , , , , , y . Analizamos las relaciones filogenéticas, las estructuras génicas, las composiciones de motivos y las distribuciones cromosómicas de los miembros de la familia HKT de la colza. Basándonos en sus relaciones filogenéticas y la agrupación de dominios funcionales, clasificamos a los miembros de HKT en cuatro subgrupos, HKT1;1 a HKT1;4. El análisis de las sustituciones no sinónimas (Ka), sustituciones sinónimas (Ks) y las proporciones Ka/Ks de pares de genes sugiere que estos genes han experimentado una fuerte presión selectiva purificadora después de la duplicación, con sus relaciones evolutivas apoyando la teoría del triángulo U. Además, los perfiles de expresión de los genes varían entre el tratamiento con potasio, fitohormonas y metales pesados. Su represión proporciona resistencia al estrés por metales pesados, posiblemente limitando la absorción. Nuestros resultados revelan sistemáticamente las características de las proteínas de la familia HKT y sus genes codificadores en seis especies y sientan una base para una exploración más profunda del papel de los genes de la familia en la tolerancia a metales pesados.