El magnesio (Mg) es el ion divalente más abundante en las plantas, participando en numerosos procesos metabólicos en el crecimiento y desarrollo. Los transportadores de Mg del tipo CorA/MRS2/ALR son esenciales para mantener la homeostasis de Mg en las plantas. Sin embargo, la proteína candidata y sus posibles funciones en la planta de tomate no se han comprendido completamente. En este estudio, identificamos siete genes MGT en tomate basándonos en la similitud de secuencia, análisis de dominios, identificación de motivos conservados y predicción de estructuras. Se analizaron dos genes en la cepa bacteriana MM281, y un ensayo funcional complementario demostró su transporte de Mg de alta afinidad. El análisis de PCR cuantitativa en tiempo real reveló que las expresiones de estos transportadores de Mg estaban reguladas a la baja en las hojas bajo limitación de Mg, con un mayor impacto en las hojas inferiores y medias en comparación con las hojas jóvenes. Por el contrario, bajo toxicidad de Mg, varios genes se regularon al alza en las hojas con un ritmo circadiano. Nuestros hallazgos indican que los miembros de la familia SlMRS2 funcionan como transportadores de Mg y sientan las bases para un análisis más profundo de sus funciones distintas en el tomate.