Identificación y evolución a nivel genómico de quinasas similares a receptores (RLKs) y proteínas similares a receptores (RLPs) en
Autores: Yang, Hua; Bayer, Philipp E.; Tirnaz, Soodeh; Edwards, David; Batley, Jacqueline
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Identificación y evolución a nivel genómico de quinasas similares a receptores (RLKs) y proteínas similares a receptores (RLPs) en
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Especies
RLKs
RLPs
Duplicaciones génicas
Especies progenitoras
Evolución
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 30
Citaciones: Sin citaciones
, una especie alotetraploide, es un recurso de germoplasma importante para la mejora de la colza, debido a sus muchos rasgos agronómicos beneficiosos, como la tolerancia al calor y a la sequía y la resistencia al tizón negro. Los genes de quinasa similar a receptores (RLK) y de proteína similar a receptores (RLP) son dos tipos de análogos de genes de resistencia (RGA) que desempeñan papeles importantes en la inmunidad innata de las plantas, la respuesta al estrés y varios procesos de desarrollo. En este estudio, se realiza un análisis a nivel genómico de RLKs y RLPs en . En total, se identifican 493 RLKs (LysM-RLKs y LRR-RLKs) y 228 RLPs (LysM-RLPs y LRR-RLPs) en el genoma de , utilizando RGAugury. Solo se observa que el 13.54% de los RLKs y el 11.79% de los RLPs están agrupados dentro de clústeres de genes. La mayoría de los RLKs (90.17%) y RLPs (52.83%) se identifican como duplicados, lo que indica que las duplicaciones de genes contribuyen significativamente a la expansión de las familias de RLK y RLP. El análisis comparativo entre y sus especies progenitoras, y , indica que el 83.62% de los RLKs y el 41.98% de los RLPs son conservados en , y es probable que los RLPs tengan una evolución más rápida que los RLKs. Este estudio proporciona un recurso valioso para la identificación y caracterización de genes candidatos de RLK y RLP.
Descripción
, una especie alotetraploide, es un recurso de germoplasma importante para la mejora de la colza, debido a sus muchos rasgos agronómicos beneficiosos, como la tolerancia al calor y a la sequía y la resistencia al tizón negro. Los genes de quinasa similar a receptores (RLK) y de proteína similar a receptores (RLP) son dos tipos de análogos de genes de resistencia (RGA) que desempeñan papeles importantes en la inmunidad innata de las plantas, la respuesta al estrés y varios procesos de desarrollo. En este estudio, se realiza un análisis a nivel genómico de RLKs y RLPs en . En total, se identifican 493 RLKs (LysM-RLKs y LRR-RLKs) y 228 RLPs (LysM-RLPs y LRR-RLPs) en el genoma de , utilizando RGAugury. Solo se observa que el 13.54% de los RLKs y el 11.79% de los RLPs están agrupados dentro de clústeres de genes. La mayoría de los RLKs (90.17%) y RLPs (52.83%) se identifican como duplicados, lo que indica que las duplicaciones de genes contribuyen significativamente a la expansión de las familias de RLK y RLP. El análisis comparativo entre y sus especies progenitoras, y , indica que el 83.62% de los RLKs y el 41.98% de los RLPs son conservados en , y es probable que los RLPs tengan una evolución más rápida que los RLKs. Este estudio proporciona un recurso valioso para la identificación y caracterización de genes candidatos de RLK y RLP.