El uso de flores comestibles se ha vuelto cada vez más popular como una buena fuente de compuestos bioactivos. Muchas flores se pueden consumir, pero hay una falta de información sobre la composición química de las flores orgánicas y convencionales. Los cultivos orgánicos representan un nivel más alto de seguridad alimentaria porque se prohíben los pesticidas y los fertilizantes artificiales. El presente experimento se llevó a cabo con flores de pensamiento comestibles orgánicas y convencionales de diferentes colores: flores de doble pigmentación violeta/amarillo y flores de pigmentación simple amarillas. En flores frescas, se determinaron los contenidos de materia seca y polifenoles (incluidos ácidos fenólicos, flavonoides, antocianinas, carotenoides y clorofilas) y la actividad antioxidante mediante el método HPLC-DAD. Los resultados mostraron que las flores de pensamiento comestibles orgánicas contenían significativamente más compuestos bioactivos, especialmente polifenoles (333.8 mg/100 g P.V.), ácidos fenólicos (40.1 mg/100 g P.V.) y antocianinas (293.7 mg/100 g P.V.) en comparación con los métodos convencionales. Las flores de pensamiento de doble pigmentación (violeta/amarillo) se recomiendan más para la dieta diaria que las flores amarillas de pigmentación simple. Los resultados son únicos y abren el primer capítulo de un libro sobre el valor nutricional de las flores comestibles orgánicas y convencionales.