Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes / en especies de fresa
Autores: Jing, Xiaotong; Zou, Quan; Yang, Hui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes / en especies de fresa
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Auxina
Crecimiento de frutos
Plantas de fresa
Genes
Análisis filogenético
Duplicaciones de genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La auxina es la primera hormona vegetal que se ha encontrado que desempeña un papel dominante en el crecimiento de los frutos, desde la formación del fruto hasta la maduración del mismo. Las plantas de fresa representan un modelo adecuado para estudiar la biosíntesis, la detección y la maquinaria de señalización de la auxina. Los genes son una familia clásica de respuesta rápida a la auxina. Sin embargo, la familia de genes en el género está poco comprendida. En este estudio, se identificaron un total de 287 genes en los ocho genomas de fresa. Sus propiedades fisicoquímicas, estructura de dominio y elementos cis-regulatorios revelaron la multiplicidad funcional de los genes de fresa. Utilizamos un análisis filogenético para clasificar estos genes en 12 clases. Además, basándonos en el análisis de sinonimia, duplicaciones de genes y el cálculo de la relación Ka/Ks, encontramos que las duplicaciones segmentarias promueven la evolución de los genes en las especies, lo que es seguido por una selección purificadora. Además, el patrón de expresión y la red de interacción proteína-proteína de estos genes revelaron diversas expresiones específicas de tejido y probables funciones regulatorias. En conjunto, estos resultados proporcionan información genómica básica y un análisis funcional de estos genes, que servirán para ampliar nuestra comprensión de la dirección en la que la familia de genes está evolucionando en las especies.
Descripción
La auxina es la primera hormona vegetal que se ha encontrado que desempeña un papel dominante en el crecimiento de los frutos, desde la formación del fruto hasta la maduración del mismo. Las plantas de fresa representan un modelo adecuado para estudiar la biosíntesis, la detección y la maquinaria de señalización de la auxina. Los genes son una familia clásica de respuesta rápida a la auxina. Sin embargo, la familia de genes en el género está poco comprendida. En este estudio, se identificaron un total de 287 genes en los ocho genomas de fresa. Sus propiedades fisicoquímicas, estructura de dominio y elementos cis-regulatorios revelaron la multiplicidad funcional de los genes de fresa. Utilizamos un análisis filogenético para clasificar estos genes en 12 clases. Además, basándonos en el análisis de sinonimia, duplicaciones de genes y el cálculo de la relación Ka/Ks, encontramos que las duplicaciones segmentarias promueven la evolución de los genes en las especies, lo que es seguido por una selección purificadora. Además, el patrón de expresión y la red de interacción proteína-proteína de estos genes revelaron diversas expresiones específicas de tejido y probables funciones regulatorias. En conjunto, estos resultados proporcionan información genómica básica y un análisis funcional de estos genes, que servirán para ampliar nuestra comprensión de la dirección en la que la familia de genes está evolucionando en las especies.